– Kích thước Amplicon: Kích thước của vùng 16S V1-V2 và vùng 16S V3-V4 (bao gồm cả đoạn mồi) lần lượt là ~350bp và ~460bp. Kích thước amplicon cuối cùng sau khi thêm đoạn mồi mã vạch lần lượt là ~486bp và ~596bp.
– Trình tự mã vạch: Có sẵn ở đây
– Thiết bị: Máy ly tâm nhỏ, máy ly tâm đĩa (máy ly tâm), hệ thống real-time PCR định lượng 96 giếng, đĩa real-time PCR 96 giếng.
– Index primers Dual index (mã vạch) để dán nhãn riêng biệt cho 96 mẫu.
Chuẩn bị > 96 mẫu Để biết hướng dẫn chuẩn bị hơn 96 mẫu, vui long nhấp vào đây.
– Hệ thống RT PCR được khuyến nghị: Bio-Rad CFX96 Real-Time PCR Detection System (bất kì cấu hình nào), Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR System.
– Mẫu đầu vào: DNA vi khuẩn tinh sạch ≤ 20 ng/µl, không chứa chất ức chế PCR.
– Khả năng tương thích trình tự: Illumina MiSeq mà không cần thêm các đoạn mồi giải trình tự tùy chỉnh. Zymo Research khuyến nghị Bộ MiSeq Reagent Kit v3 (600 chu kỳ).