Chứng chỉ

Thương hiệu

Zymo Research

Loại sản phẩm

Hóa chất

Điểm nổi bật

Giải trình tự 16S rRNA là một kỹ thuật thường quy để lập hồ sơ thành phần hệ vi sinh vật. So với giải trình tự metagenomics shotgun, giải trình tự 16S rRNA tiết kiệm chi phí hơn và mạnh mẽ hơn; nó thường yêu cầu ít DNA đầu vào hơn và ít bị ảnh hưởng bởi sự hiện diện của DNA vật chủ. Tuy nhiên, giải trình tự 16S rRNA cũng có những thách thức riêng. Một thách thức lớn là sự hình thành các trình tự PCR chimeric, là các trình tự nhân tạo thu được từ sự tái tổ hợp của hai hoặc nhiều khuôn mẫu PCR. Ngoài ra, với các đoạn mồi 16S thông thường, rất khó để đạt được cả độ phân giải cấp loài và phạm vi phát sinh loài rộng. Hơn nữa, các quy trình chuẩn bị thư viện 16S thông thường được sử dụng trong lĩnh vực này chưa được tối ưu hóa để tiết kiệm chi phí cho các ứng dụng quy mô lớn. Bộ Quick-16S NGS Library Prep Kit nhằm mục đích chuẩn hóa quy trình chuẩn bị thư viện để giải trình tự 16S rRNA. Các tính năng nổi bật của bộ kit được mô tả dưới đây. 16S rRNA Library Prep nhanh nhất. Bộ dụng cụ chuẩn bị thư viện NGS Quick-16S sử dụng real-time PCR (định lượng) (qPCR) thay vì PCR điểm cuối để khuếch đại rRNA 16S, cho phép định lượng trực tiếp các sản phẩm PCR và loại bỏ nhu cầu phân tích định lượng thư viện bổ sung như phân tích TapeStation hoặc điện di gel. Quá trình làm sạch bằng enzym được đưa vào giữa hai bước PCR, giúp tiết kiệm thời gian và giảm chi phí so với quá trình làm sạch dựa trên hạt AMPure kéo dài. Với các tính năng này, bộ kit giảm đáng kể thời gian thực hành chuẩn bị thư viện 16S. Đơn giản. Bộ Quick-16S NGS Library Prep Kit bao gồm tất cả các thuốc thử cần thiết để chuyển đổi 96 mẫu DNA thành thư viện 16S. Thư viện thu được tương thích trực tiếp với Illumina MiSeq mà không cần thêm các đoạn mồi giải trình tự tùy chỉnh. Chính xác. Việc sử dụng PCR thời gian thực cũng cho phép người dùng kiểm soát các chu kỳ PCR. Điều này hạn chế sự hình thành chimera và độ lệch PCR trong khi vẫn thu được đủ sản phẩm để giải trình tự tiếp theo. Trong hầu hết các trường hợp, sự phong phú của các trình tự chimera PCR được duy trì dưới 2%. Tăng độ bao phủ. Do sự mở rộng nhanh chóng của cơ sở dữ liệu 16S rRNA, phạm vi bao phủ vi khuẩn không đủ của các bộ mồi 16S phổ biến đã trở nên rõ ràng. Zymo Research đã thiết kế lại hai bộ mồi phổ biến nhắm vào các vùng 16S V1-V2 và 16S V3-V4 dựa trên cơ sở dữ liệu tham chiếu 16S mới nhất và cải thiện đáng kể phạm vi bao phủ của chúng.

Ứng dụng

– Kích thước Amplicon: Kích thước của vùng 16S V1-V2 và vùng 16S V3-V4 (bao gồm cả đoạn mồi) lần lượt là ~350bp và ~460bp. Kích thước amplicon cuối cùng sau khi thêm đoạn mồi mã vạch lần lượt là ~486bp và ~596bp.
– Trình tự mã vạch: Có sẵn ở đây
– Thiết bị: Máy ly tâm nhỏ, máy ly tâm đĩa (máy ly tâm), hệ thống real-time PCR định lượng 96 giếng, đĩa real-time PCR 96 giếng.
– Index primers Dual index (mã vạch) để dán nhãn riêng biệt cho 96 mẫu.
Chuẩn bị > 96 mẫu Để biết hướng dẫn chuẩn bị hơn 96 mẫu, vui long nhấp vào đây.
– Hệ thống RT PCR được khuyến nghị: Bio-Rad CFX96 Real-Time PCR Detection System (bất kì cấu hình nào), Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR System.
– Mẫu đầu vào: DNA vi khuẩn tinh sạch ≤ 20 ng/µl, không chứa chất ức chế PCR.
– Khả năng tương thích trình tự: Illumina MiSeq mà không cần thêm các đoạn mồi giải trình tự tùy chỉnh. Zymo Research khuyến nghị Bộ MiSeq Reagent Kit v3 (600 chu kỳ).

Thông số kỹ thuật

• Nhanh nhất: Chỉ mất 1,5 giờ thực hiện. Không có phân tích Tapestation® hoặc AMPure® clean-ups
• Chính xác: Việc sử dụng real-time PCR hạn chế sự hình thành chimera trong PCR.
• Tăng độ bao phủ: Novel primers làm tăng phạm vi phát sinh loài của Vi khuẩn và Cổ khuẩn và cho phép phân giải cấp độ loài để lập hồ sơ hệ vi sinh vật ở người.

Thông tin khác
Cat # Name Size
D6400 Quick-16S NGS Library Prep Kit 96 rxns

Sản phẩm liên quan

TaqPath™ 1-Step Multiplex Master Mix (No ROX)

TaqPath 1-Step Multiplex Master Mix (Không có ROX) là hỗn hợp RT-qPCR 4X, một ống, nhanh, nhạy, có thể lặp lại phát hiện lên đến bốn mục tiêu RNA/DNA khác nhau trong một phản ứng multiplex duy nhất. Đặc biệt hữu ích cho chẩn đoán và dược phẩm sinh học với các ứng dụng trong phát hiện mầm bệnh vi-rút và quy trình biểu hiện gen thông lượng cao, hỗn hợp bao gồm phiên mã ngược MMLV chịu nhiệt, dNTP, UNG và DNA polymerase Fast chịu nhiệt, tất cả trong một ống duy nhất. TaqPath được sản xuất theo hệ thống quản lý chất lượng ISO13485 mạnh mẽ và được thiết kế để tạo ra hiệu suất sản phẩm nhất quán sau từng lô.

TaqMan Fast Advanced Master Mix

TaqMan Fast Advanced Master Mix cung cấp khả năng định lượng chính xác và độ tin cậy trong thời gian ngắn trên các nền tảng thiết bị qPCR.

Rhodamine 6G

Thông tin sản phẩm

Model: RHODAMINE 6G

Hãng sản xuất: Lynn Peavey

Xuất xứ: Mỹ

Labcyte

Công cụ phòng lab tiên tiến nhất dành cho nghiên cứu khoa học.

Công nghệ giọt treo âm thanh Echo acoustic là bước đột phá cho giải pháp tự động hóa với khả năng không dính, không nhiễm mẫu, độ chính xác và tốc độ cao trong thao tác hút nhả mẫu lỏng sử dụng năng lượng âm thanh (Với mẫu từ 2.5 đến 25 nL).

Sóng âm thanh vận chuyển mẫu dưới dạng giọt treo với thể tích mẫu chính xác từ đĩa chứa cho tới đĩa đích treo. bên trên.

Với dải sản phẩm rộng bao gồm:

Echo 650 Liquid Handler

Echo 655 Liquid Handler

Echo 655T Liquid Handler

Echo 650T Liquid Handler

Echo 525 Liquid Handler

Echo 555 Liquid Handler

Hệ thống tự động Biomek i7

Thiết kế cho các quy trình phát triển của bạn Hệ thống xử lý chất lỏng tốt nhất, dẫn đầu thị trường – được kết nối với các phần bổ sung theo đề xuất từ các khách hàng trên toàn cầu

Hệ thống tự động Biomek i7 được thiết kế để tối ưu quy trình và tăng thời gian “walk-away” ở các phòng lab công suất trung bình đến lớn.

Hệ thống tự động Biomek i5

Tối ưu hóa độ tin cậy và thời gian “walk-away”. Biomek i5 là hệ thống mới nhất trong các hệ thống xử lý chất lỏng và là hệ thống tốt nhất, dẫn đầu thị trường – được kết nối với các phần bổ sung theo đề xuất từ các khách hàng trên toàn cầu.

– Phù hợp với các quy trình công suất trung bình đến lớn

– 25 vị trí deck

– Khoảng thể tích pipet 0.5 µL-1,000 µL (Đa kênh) hoặc 0.5 µL-5,000 µL (Span-8)

– Đầu đa kênh đơn (96/384) hoặc pipet Span-8 có kẹp

Quick-RNA Viral

Viral DNA and RNA from all biological fluids:
– Quick recovery of viral RNA from plasma, serum and other samples.
– Omits the use of organic denaturants and proteases.
– High-quality viral RNA is ready for RT-PCR, sequencing, etc.

TruSight Tumor 170 Kit

TruSight Tumor 170 Kit includes library preparation reagent set and uses next-generation sequencing (NGS) technology to provide a comprehensive assessment of 170 genes that are commonly related to mutations in solid tumors and somatic variants.

Công nghệ Microarray – ILMN Microarray Solutions

Công nghệ Microarray BeadArray được sử dụng trong các sản phẩm array của Illumina và các máy scanner trong một loạt các ứng dụng phân tích DNA và RNA.

TruSight HLA v2 Sequencing Panel

TruSight HLA v2 Sequencing Panel là bộ kit chuẩn bị thư viện HLA cho quá trình giải trình tự HLA trên hệ thống giải trình tự gen thế hệ mới (NGS – Next Generation Sequencing) của hãng Illumina
Kháng nguyên bạch cầu ở người (Human leukocyte antigen – HLA) đóng một vai trò quan trọng giúp hệ miễn dịch nhận ra và loại bỏ những tác nhân lạ, xâm lấn, những tế bào bị hỏng, sai chức năng hoặc bị nhiễm khuẩn để chống lại bệnh tật và duy trì tình trạng khỏe mạnh của cơ thể.
Sự đột biến HLA có thể tạo ra phản ứng đáp ứng miễn dịch bất thường và có liên quan đến các bệnh / rối loạn tự miễn, ung thư, đào thải trong cấy ghép nội tạng và nhạy cảm với thuốc.